Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms