Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM25Q14258 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms