Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms