Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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