Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms