Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms