Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms