Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms