Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
POLR2KP53803 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
POLR2KP53803 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
POLR2KP53803 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
POLR2KP53803 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
POLR2KP53803 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
POLR2KP53803 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
POLR2KP53803 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
POLR2KP53803 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
POLR2KP53803 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
POLR2KP53803 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
POLR2KP53803 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms