Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms