Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NESP48681 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NESP48681 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NESP48681 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NESP48681 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
NESP48681 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NESP48681 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NESP48681 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NESP48681 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NESP48681 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms