Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPOP42166 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPOP42166 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms