Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms