Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPREP23469 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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