Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT4P19013 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT4P19013 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT4P19013 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms