Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLK3P07288 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms