Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3AO14802 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms