Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms