Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms