Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL27Q9Y4X3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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