Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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