Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms