Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms