Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms