Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMNQ96JQ2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMNQ96JQ2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms