Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms