Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3CQ92520 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms