Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms