Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms