Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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C10orf55Q5SWW7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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