Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms