Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC5A12Q1EHB4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC5A12Q1EHB4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC5A12Q1EHB4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms