Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZFHX3Q15911 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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