Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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