Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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