Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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