Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms