Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP1Q13835 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKP1Q13835 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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