Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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