Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR4Q13639 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms