Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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