Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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