Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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FOXC1Q12948 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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FOXC1Q12948 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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FOXC1Q12948 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FOXC1Q12948 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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