Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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