Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms