Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms