Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BACE1P56817 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms