Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTGIRP43119 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms