Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA11P31270 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms