Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms